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Un nuevo proyecto de código abierto ofrece herramientas y datos para mejorar la precisión y la coherencia en la investigación de transcriptómica espacial.
Una nueva iniciativa de código abierto llamada Spatial Touchstone, desarrollada por múltiples instituciones de investigación, tiene como objetivo mejorar la fiabilidad de la transcriptómica espacial proporcionando herramientas estandarizadas de control de calidad, conjuntos de datos seleccionados de seis tipos de tejidos y el software Spatial QM para evaluar la precisión de los datos.
El proyecto, dirigido por Jasmine Plummer del Hospital de Investigación Infantil St. Jude, ofrece protocolos y un portal fácil de usar para ayudar a los investigadores a detectar problemas técnicos tempranamente, mejorando la reproducibilidad en laboratorios y plataformas.
Publicado en Nature Biotechnology, el esfuerzo apoya la calidad consistente de los datos en la investigación biomédica a medida que avanza la tecnología.
A new open-source project offers tools and data to improve accuracy and consistency in spatial transcriptomics research.